Muitas áreas da floresta ainda são um mistério. Mesmo hoje, a maioria dos afluentes do Amazonas ainda são inexplorados. Há cerca de 15.000 espécies de criaturas no Amazonas. Milhares delas, incluindo pássaros, peixes e centenas de mamíferos ainda não têm sido classificadas. Dentre as espécies conhecidas que são encontradas na floresta, estão a onça, o macaco prego, a preguiça, o tatu, o jacaré, a jibóia e a sucuri. Alguns dos pássaros encontrados na floresta são os tucanos, os papagaios, as araras, os beija-flores e os gaviões. Ainda há mais de 1.800 espécies de borboletas e mais de 200 espécies de mosquitos. Peixes como a piranha e a enguia juntam-se a uma imensidão de espécies que os biólogos são incapacitados de identificar nas bancas dos mercados locais.
Manaus é um dos pontos de partida mais comuns para as trilhas do Amazonas. É localizada perto do Rio Negro, seis milhas acima da junção dos Rios Solimões e Negro. As viagens que duram um dia e as excursões de barco, permitem uma vista íntima da selva e a chance de ver como é a vida diária dos habitantes locais das cidades à beira do Amazonas.
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